Diferentes estudios realizados por la UICN, el Instituto de las Ciencias del Mar del CSIC ( Consejo Superior de Investigaciones Científicas), junto con otros científicos de organizaciones y organismos nacionales e internacionales, aconsejan incluir esta zona del Mar Mediterráneo como zona de especial interés y que debería quedar protegida de aquí al 2020.

Los criterios que se han utilizado a la hora de priorizar las áreas de especial protección han tenido en cuenta la riqueza del mar, la biodiversidad, la pesca y el impacto sobre la costa. La importancia ecológica del Mar de Alborán se acentúa con su carácter de zona transición entre el interior de la cuenca Mediterránea y el Océano Atlántico.

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